1931年“九·一八事件”后，日本帝國主義占領我國東北，并進逼華北。為謀文物安全，當時遂有選擇精品遷址儲藏之籌備。文物運輸前，院方向行政院和地方軍政長官發出密電，請沿途保護。路線避開天津，繞道南下，以免遭日軍襲擊。列車全部是鐵皮車，車頂四周均架起機槍，車兩旁逐段有馬隊隨車馳聚，每到一站，地方官派人上車交差。重要關口，車內熄燈。 2月7日 第一批南遷文物起運。古物館452箱，圖書館602箱，文獻館1,064箱，共2,118箱。吳瀛等監運。3月5日抵滬。 3月15日 第二批南遷文物起運。秘書處426箱，古物館384箱，圖書館44箱、文獻館436箱，共1,290箱。俞同奎等監運。21日抵滬。 3月28日 第三批南遷文物起運。秘書處1,013箱又62包，古物館242箱，圖書館477箱，文獻館1,240箱，共2,922箱又62包。程星齡等監運。4月5日抵滬。 4月19日 第四批南遷文物起運。秘書處2,635箱又2包，古物館829箱，圖書館138箱，文獻館1,033箱，共4,635箱又2包。馬衡等監運。27日抵滬。 5月15日 第五批南遷文物起運。秘書處1,534箱，古物館724箱，圖書館154箱，共2,412箱。俞同奎等監運。23日抵滬。 南遷文物總計13,427箱又64包。附我院一同運滬者另有古物陳列所5,414箱，頤和園640箱又8包3件，國子監11箱。 1936年，南京朝天宮文物庫房建成后，南遷文物遂分五批運往南京。

故宮博物院： 欣聞貴院網站即將開通，我謹代表南京博物院表示熱烈的祝賀！ 我國的文博事業在黨的正確領導下，經過幾代人的艱苦努力，形成了蓬勃發展的局面，尤其是在改革開放的新時期，博物館事業更是開始了大踏步地向前發展，肩負起了弘揚祖國優秀傳統文化、宣傳愛國主義、普及科學技術、建設精神文明的重任。隨著信息技術的深入發展和廣泛應用，博物館也將借助這一現代化的手段而翻開嶄新的發展篇章。時值新世紀的開端，貴院網站的揭幕和其他博物館網站的建設標志著我國博物館事業開始步入了信息時代。我們相信隨著我國博物館信息化建設的深入發展，藏品的保管和研究、文物保護、展示等手段都將出現根本性的轉變；博物館局域網接入國際互聯網后，將帶入大量的文物資源，由此將促生大量的虛擬博物館，使博物館真正地走入千家萬戶。因此我們有理由展望信息技術為博物館帶來的美好前景。 最后，我衷心祝愿故宮博物院網站欣欣向榮，成為我國博物館信息化建設的楷模！ 恭祝 安祈 南京博物院院長 徐湖平 2001年7月12日